Елена Владимировна, ситуация с которой Вы столкнулись, к сожалению, не единична. Мы предлагаем своим клиентам следующий выход из ситуации. В договорах с поставщиками прописать отдельным пунктом (сделать дополнительное соглашение) о том, что в случае выставления счетов-фактур с нарушением требований Налогового кодекса  и 914 постановления поставщик возмещает покупателю все расходы (штрафы) связанные с непринятием, в том числе, (непринятием фискальными органами) входящего НДС к вычету у покупателя.